中大医学院开创儿童宏基因组组装基因组数据库(MAGIC) 促进生命早期微生物群研究
香港中文大学(中大)医学院的研究团队成功开创儿童宏基因组组装基因组数据库(Metagenome-Assembled Genome Inventory for Children,MAGIC)。 此开创性的全球宏基因组组装基因组数据库有助了解生命早期肠道微生物群的发展变化。自婴儿时期起微生物群与人类健康的相互作用错综复杂,团队建立的MAGIC数据库为全球生命早期微生物组研究奠定坚实的基础并开辟了新的前景。是次研究结果已於国际期刊《Cell Host & Microbe》发表。
MAGIC拓展基因组数据的版图提供更精准的生命早期微生物群图谱
生命早期的肠道微生物群对於免疫和代谢功能的发展至关重要,而目前的微生物群资料库主要以成人序列为基础,且绝大部分来自西方人群,局限了人们对婴儿微生物发育及其如何影响健康状况的理解。
是次研究的高级作者、中大医学院赛马会公共衞生及基层医疗学院副教授及香港微生物菌群创新中心(MagIC)副总监黄世万教授表示:「全面了解生命早期微生物群,对於促进长期健康至关重要。」他补充说:「我们的MAGIC数据库通过改善年龄和地域代表性,为推动微生物群基础科学以及利用微生物群靶向疗法促进健康的临床研究带来新的希望。」
MAGIC数据库从87项研究当中搜集了年龄介乎零至七岁儿童的20,172 个肠道宏基因组,其中包括来自中大医学院2019年开始建立的「三岁定八十」出生队列的613个宏基因组,扩大了地域多样性。该数据库包含3,299个原核基因组和139,624 个病毒基因组。
是次研究的主要作者、中大医学院赛马会公共衞生及基层医疗学院博士后研究员彭也博士表示:「值得关注的是,8.5%的原核基因组和63.9%的病毒基因组为我们MAGIC数据库所独有。 这些新序列能够更精准地分析早期生命微生物群。我们的研究也确定了54个与儿童健康相关的微生物群体关键物种,这些物种亦与地域及年龄相关因素有关。」
研究发现多个与婴儿健康相关的关键微生物物种 有望及早预防疾病及促进健康
另一位高级作者、中大医学院裘槎医学科学教授、香港微生物菌群创新中心总监及新基石研究员黄秀娟教授强调是次研究的结果的临床意义:「中大医学院团队识别婴儿健康和疾病发展的作用关键微生物物种,爲在生命早期预防过敏等疾病的『从0到1』突破奠定了基础。」
MAGIC数据库是推动婴儿个人化治疗的重要资源,因此早期微生物介入对於促进终身健康尤其重要。
研究的通讯作者之一、中大医学院麻醉及深切治疗学系助理教授;及香港微生物菌群创新中心首席科学家张琳教授补充:「目前全球对母婴肠道微生物的认知,主要来自欧美出生队列研究。 MAGIC数据库首次纳入以中国人群为基础的『三岁定八十』基因组数据,将使中国在国际生命早期微生物组研究的世界版图占一席之位。」
研究团队期望这次发现将启发更多人进一步研究生命早期肠道微生物群对健康和疾病的角色,并因此制定出崭新的疾病预防和促进健康策略。
是次研究由研究资助局及香港特别行政区政府InnoHK资助。