中大醫學院開創兒童宏基因組組裝基因組數據庫（MAGIC） 促進生命早期微生物群研究
香港中文大學（中大）醫學院的研究團隊成功開創兒童宏基因組組裝基因組數據庫（Metagenome-Assembled Genome Inventory for Children，MAGIC）。 此開創性的全球宏基因組組裝基因組數據庫有助了解生命早期腸道微生物群的發展變化。自嬰兒時期起微生物群與人類健康的相互作用錯綜複雜，團隊建立的MAGIC數據庫為全球生命早期微生物組研究奠定堅實的基礎並開闢了新的前景。是次研究結果已於國際期刊《Cell Host & Microbe》發表。
研究團隊成員包括（左起）中大醫學院麻醉及深切治療學系助理教授及香港微生物菌群創新中心（MagIC）首席科學家張琳教授；中大醫學院裘槎醫學科學教授、MagIC總監及新基石研究員黃秀娟教授；中大醫學院賽馬會公共衞生及基層醫療學院副教授及MagIC副總監黃世萬教授；及是次研究主要作者、中大醫學院賽馬會公共衞生及基層醫療學院博士後研究員彭也博士。
MAGIC拓展基因組數據的版圖提供更精準的生命早期微生物群圖譜
生命早期的腸道微生物群對於免疫和代謝功能的發展至關重要，而目前的微生物群資料庫主要以成人序列為基礎，且絕大部分來自西方人群，局限了人們對嬰兒微生物發育及其如何影響健康狀況的理解。
是次研究的高級作者、中大醫學院賽馬會公共衞生及基層醫療學院副教授及香港微生物菌群創新中心（MagIC）副總監黃世萬教授表示：「全面了解生命早期微生物群，對於促進長期健康至關重要。」他補充說：「我們的MAGIC數據庫通過改善年齡和地域代表性，為推動微生物群基礎科學以及利用微生物群靶向療法促進健康的臨床研究帶來新的希望。」
MAGIC數據庫從87項研究當中搜集了年齡介乎零至七歲兒童的20,172 個腸道宏基因組，其中包括來自中大醫學院2019年開始建立的「三歲定八十」出生隊列的613個宏基因組，擴大了地域多樣性。該數據庫包含3,299個原核基因組和139,624 個病毒基因組。
是次研究的主要作者、中大醫學院賽馬會公共衞生及基層醫療學院博士後研究員彭也博士表示：「值得關注的是，8.5%的原核基因組和63.9%的病毒基因組為我們MAGIC數據庫所獨有。 這些新序列能夠更精準地分析早期生命微生物群。我們的研究也確定了54個與兒童健康相關的微生物群體關鍵物種，這些物種亦與地域及年齡相關因素有關。」
MAGIC 數據庫開創性地識別出獨有的原核和病毒基因組以及54個關鍵微生物物種，有望協助研究人員在解構如何在生命早期預防過敏等疾病時，實現「從0到1」的突破。
研究發現多個與嬰兒健康相關的關鍵微生物物種有望及早預防疾病及促進健康
另一位高級作者、中大醫學院裘槎醫學科學教授、香港微生物菌群創新中心總監及新基石研究員黃秀娟教授強調是次研究的結果的臨床意義：「中大醫學院團隊識別嬰兒健康和疾病發展的作用關鍵微生物物種，爲在生命早期預防過敏等疾病的『從0到1』突破奠定了基礎。」
MAGIC數據庫是推動嬰兒個人化治療的重要資源，因此早期微生物介入對於促進終身健康尤其重要。
研究的通訊作者之一、中大醫學院麻醉及深切治療學系助理教授；及香港微生物菌群創新中心首席科學家張琳教授補充：「目前全球對母嬰腸道微生物的認知，主要來自歐美出生隊列研究。 MAGIC數據庫首次納入以中國人群為基礎的『三歲定八十』基因組數據，將使中國在國際生命早期微生物組研究的世界版圖佔一席之位。」
研究團隊期望這次發現將啟發更多人進一步研究生命早期腸道微生物群對健康和疾病的角色，並因此制定出嶄新的疾病預防和促進健康策略。
是次研究由研究資助局及香港特別行政區政府InnoHK資助。
