中大成功破解鼻咽癌全基因组图谱 突破性结果有助发展个人化治疗
香港中文大学(中大)医学院的研究人员,成功破解鼻咽癌的全基因组图谱。是次突破性发现有助评估鼻咽癌病人的预后情况,亦为发展鼻咽癌的个人化治疗迈出一大步。相关研究结果已刊载於国际顶尖科学期刊《Nature Communications》。
鼻咽癌是本港以至华南地区常见的癌症,亦是一种极具侵略性的头颈癌,癌细胞经常会转移到淋巴结和其他器官。根据香港癌症资料统计中心[1],每年本港的鼻咽癌新症达800宗。鼻咽癌大多与感染EB病毒(Epstein-Barr Virus)相关。由於缺乏早期病徵,60%至70%患者於确诊时已届晚期,治疗效果较差。
医学界缺乏全面的鼻咽癌基因数据
为了解EB病毒阳性鼻咽癌的基因结构,中大研究人员於2015至2016年间为超过100名感染EB病毒的鼻咽癌患者(年龄中位数是49岁,男性占七成)的肿瘤样本进行「全外显子组测序(whole-exome sequencing)」,并为当中部分个案的样本进行「全基因组测序(whole-genome sequencing)」,结果在癌细胞中发现到的基因变异及结构变异,较过往研究所发现的多;研究人员亦因此发现多种助长鼻咽癌肿瘤生长的崭新基因特质,包括负责调节细胞发炎机制「NF-κB通道」的蛋白,倘若出现基因突变便会失去原有作用,引发癌症。
中大李树芬医学基金肿瘤学讲座教授暨香港癌症研究所包玉刚癌症中心总监陈德章教授表示:「在缺乏鼻咽癌基因数据的情况下,医学界难以掌握这种癌症的发展机制,因而较难为病人度身订造最理想的治疗方案。」
最大规模研究以找出鼻咽癌基因结构
中大研究人员将所有样本在显微镜下进行癌细胞分离(microdissection),并提取脱氧核糖核酸(DNA)以进行「全外显子组测序」。由於外显子组仅占整个基因组图谱大约1%,为掌握更多有关鼻咽癌的基因数据,研究人员再将部分个案的样本进一步进行「全基因组测序」。
中大医学院病理解剖及细胞学系系主任杜家辉教授指出:「我们是次进行『全外显子组测序』分析所使用的样本数目,在已发表的同类研究中属於最大规模,而今次亦是已公布的研究中,首个有系统地进行鼻咽癌全基因组测序分析的研究,成功拆解鼻咽癌的全基因组图谱。透过如此全面的基因数据,有助我们能够成功找出一些崭新而重要的鼻咽癌标靶和生物标记。」
基因数据有助发展个人化治疗及预后评估
研究结果发现与鼻咽癌相关的细胞基因变异,比过往研究所找到的多,这或能够解释为何免疫治疗或标靶治疗在不同病人身上,会有相异的临床反应。研究结果亦显示,极多鼻咽癌个案是由於细胞内负责调节发炎机制「NF-κB通道」的多种蛋白出现基因突变,失去原有的调节功能,「NF-κB通道」因而被启动,有利癌细胞生长。
中大医学院病理解剖及细胞学系教授罗国炜教授解释:「是次研究显示基因组学对发展鼻咽癌治疗大有帮助。这些基因数据既有助医生评估病人接受特定治疗的预后情况,亦确认了针对『NF-κB通道』而开发相关的抑制性药物是治疗鼻咽癌的正确方向。」
中大医学院肿瘤学系名誉临床副教授许斌医生总结:「我们正在进行的新药临床研究,已有部分病人获益,而发展个人化治疗的目的正是为了能丰富这些临床研究。我们将根据是次研究中发现的新基因特质,开发一个全新的生物标记平台,帮助患者选择合适的治疗,并针对新发现的遗传靶点测试新药,希望能惠及更多癌症病人。」
[1]香港癌症资料统计中心 http://www3.ha.org.hk/cancereg/tc/default.asp